“数码宝贝是数据资料”的概念经过第一二部的铺垫，第三部迎来小高潮：数码宝贝世界与人类世界的连接不仅需要电脑，其间还需要通过某种数据层（前两部表现为神圣计划）进行“实体化”，两个世界以数据连接（人类也能成为资料）进而成为一种共同体，方舟（承载肉体）和黑洞（另类次元）都能作为媒介“实体化”的具体。单亲家庭、重组家庭、双胞胎家庭等社会现象被囊括在内，以矫正所谓的“不正常”心理，但过多集中于三位主角，他人的成长轨迹没有铺展开，树莉的黑化虽是情节推动的关键却没得到值得的重视（但其间的恐怖感刻画得尤其深刻），反观大人，他们自诩懂得这个世界的生存法则，回复术士的重来人生认为牺牲是理所应当（如结局），对孩子虚伪的关心成为隐埋的糖衣炮弹，至毒且致命。